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殼聚糖對大腸桿菌、熒光假單胞菌、金黃色葡萄球菌、枯草桿菌等有良好的抑制作用，并且還能抑制鮮活食品的生理變化。殼聚糖天然無毒，適用于偏酸性及含蛋白質少的食品保鮮，遇高分子和離子性復合物可凝集。例如水果的防腐保鮮，用量為醋酸0.1%+殼聚糖0.05%-0.1%。

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殼聚糖被發現已經有100多年，也有許多人在對它進行研究，廣泛應用于農業、食品、醫療、工業。 [6] 甲殼素及其衍生物的用途大量研究表明，甲殼質及其衍生物具有成膜性、可紡性、抗凝血性，促進傷口愈合等功能。因此，甲殼質及其衍生物在食品、生化、醫藥、日用化妝品及污水處理等眾多領域得到廣泛的應用，將其主要用途歸納如下。

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殼聚糖肥料對土壤的改良作用：殼聚糖肥料中的殼聚糖分子可以通過與土壤顆粒相互結合，改良土壤結構，提高土壤的通透性和保水能力，增強土壤肥力，促進有益微生物的生長。殼聚糖肥料對作物生長的影響：研究表明，殼聚糖肥料能夠促進作物的根系生長，增強作物的抗逆性，提高作物的抗病蟲害能力，改善作物的品質和產量。

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甲殼素在反應中生成帶正電荷的陽離子基團，這是自然界中存在的帶正電荷的可食性食物纖維。甲殼素食物纖維單獨食用是不易被消化吸收的，如果與牛奶、雞蛋、蔬菜、植物性食品等一起食用就可以被吸收，這是因為在殼糖胺酶、去乙酰酶（在植物和腸內細菌中存在）、溶菌酶（體內存在）及卵磷脂（牛奶、雞蛋中存在）等共同作用下甲殼素可以被分解成寡聚糖，低相對分子質量的寡聚糖可以被吸收，吸收部位主要在大腸。